• Η ηλεκτρονική καταχώριση των εισερχομένων και εξερχόμενων εγγράφων, πλην αυτών που έχουν εμπιστευτικό χαρακτήρα.
• Η διανομή των εισερχομένων εγγράφων στα αρμόδια τμήματα. Η μεταφορά του ταχυδρομείου στο κέντρο διαλογής Αθηνών και η παραλαβή από αυτό της αλληλογραφίας της υπηρεσίας, το άνοιγμα των φακέλων, η ταξινόμηση των εγγράφων και η διανομή τους σε αντίστοιχα τμήματα.
• Η διακίνηση δικογραφιών και εγγράφων μεταξύ της Εισαγγελίας και των λοιπών Δικαστικών Αρχών της Χώρας καθώς και των Υπουργείων και λοιπών φυσικών και νομικών προσώπων.
• Η προετοιμασία της αλληλογραφίας του Διευθύνοντος.
• Η παροχή πληροφοριών στο κοινό περί της πορείας των εγγράφων που καταχωρούνται στους Η/Υ του πρωτοκόλλου.

Στο τμήμα αυτό ορίζεται να υπηρετούν δέκα (10) δικαστικοί υπάλληλοι και τέσσερις (4) επιμελητές.